Manajemen sekolah merupakan faktor yang paling penting dalam menyelenggarakan pendidikan dan pengajaran di sekolah yang keberhasilannya diukur oleh prestasi yang didapat. Oleh karena itu dalam menjalankan kepemimpinan, harus menggunakan suatu sistem, artinya dalam penyelenggaraan pendidikan di sekolah yang di dalamnya terdapat komponen-komponen terkait seperti guru-guru, staff TU, orang tua siswa, masyarakat, pemerintah, anak didik, dan lain-lain harus berfungsi optimal yang dipengaruhi oleh kebijakan dan kinerja pimpinan.
Tantangan lembaga pendidikan adalah mengejar ketertinggalan artinya kompetisi dalam meraih prestasi terlebih dalam menghadapi persaingan global.
SMKKN Manokwari memiliki dinamika lebih kompleks, yakni tidak hanya hal-hal terkait penyampaikan materi pendidikan, akan tetapi juga pendidikan di luar jam sekolah. Hal ini terjadi karena di SMKKN Manokwari memiliki asrama atau tempat menginap bagi siswa, sehingga memerlukan pengawasan dan pengarahan yang ekstra. Maka sangat penting ilmu manajemen konflik bagi pegawai yang memiliki tanggung jawab tersebut.
